Todo comienza en un mundo donde los Pokémon y los humanos pueblan la Tierra. Estos son criaturas que habitan todos los lugares, desde el fondo del mar hasta la montaña mas alta, y pueden ser capturados por las personas, y estas pueden entrenarlos para pelear contra otros Pokémon.

Ash, un pequeño chico, que como cualquier chico de este mundo, tiene que comenzar su vida como entrenador Pokémon. Su tutor, el Profesor Oak, es el encargado de entregarle el primer Pokémon que tendrá, pero Ash, al llegar tarde a la entrega de Pokémon, recibe un Pikachu muy testarudo, un reto para el. También recibe un Pokédex, que es un aparato que guarda y recopila información sobre los Pokémon que Ash vaya encontrando. Y para terminar con la entrega de su equipo, conoce a Gary, otro chico entrenador que le pone un reto: Llegar a ser el mejor entrenador Pokémon. Ash acepta el reto, y después de despedirse de su madre, comienza su viaje.

Ash tuvo luego problemas con un grupo de Pokémon voladores, y pide prestada la bicicleta a Misty, una chica que pasaba por donde iba Ash. Pero después de acabar con la bicicleta, Misty sigue a Ash hasta que el se la pague. Ahí es donde conocen al Equipo Rocket, quienes son los bandidos mas famosos de todo el lugar, y se interesan mucho por el Pikachu de Ash.

Después de varias peleas Pokémon, y de escapes del Equipo Rocket, Ash llega al gimnasio de Brock, quien después de ser vencido por el, se une a Ash para llegar a ser el mejor criador Pokémon.

Esto es solo el comienzo de la serie. Además con la salida de las películas y juegos de Pokémon, se han agregado mas Pokémon a los 150 originales, por lo que en la actualidad se conocen más de 386 especies de Pokémon.